广西南糖种业有限公司是南宁糖业全资子公司，于2021年成立。是南宁糖业为了积极推进糖业科技转型升级，大力提升糖业科技创新能力和水平，拓展公司产业链，切实增强糖业产业综合竞争实力出资成立的有限责任公司。

南糖种业公司通过建设甘蔗良种繁育及配套技术示范基地，打造桂糖甘蔗组培苗技术推广中心，促进甘蔗产业转型升级，业务内容包括为制糖公司做好订单健康甘蔗种茎服务；探索甘蔗优质品种的规模化运营，推进健康甘蔗种苗的现代化建设，甘蔗健康种苗的现代化技术应用推广、种苗推广、新技术引进应用、水肥一体化示范建设等。